人类错配修复(MMR)基因除了检验和校正复制期间发生在微卫星样重复DNA序列上小的插入和丢失之外，还防止解旋的DNA序列重新结合。MMR基因突变破坏了MMR蛋白的功能，引起重复DNA序列的产生及DNA修复错误，从而导致患者DNA出现微卫星不稳定(MSI)。Lynch综合征是一种由错配修复(MMR)基因种系突变引起的常染色体显性遗传病。
MSI检测具有重要临床意义：
1、诊断Lynch综合征：MSI是Lynch综合征的重要生物学标记，当MSI-H被证实，该诊断即可成立;
2、判断预后及治疗效果：MSI-H的结直肠癌患者对化疗药物5-氟尿嘧啶的疗效不佳;
3、鉴别遗传性胚系来源与散发性来源的MSI结直肠癌：散发性MSI-H结直肠癌的病因通常是hMLH1基因启动子甲基化，只有小部分为BRAF基因突变致MMR基因沉默而免疫组化阴性，并出现MSI。若肿瘤MMR基因启动子甲基化或BRAF基因突变阳性，说明为散发性癌;
4、筛查：Bethesda修订指南建议对小于50岁的患者常规进行MSI检测。
根据Bethesda修订指南，有下列指征的患者需做MSI检测：
1、患者年龄小于50岁;
2、肿瘤位于右半结肠;
3、易发生肠内或肠外其他器官的多发性肿瘤;
4、术后易再发其他原发性恶性肿瘤;
5、肿瘤有淋巴细胞浸润;
6、多分泌黏蛋白或有印戒细胞;
7、浸润性生长模式。
MSI检测目前有以下两种检测方法：
1、PCR技术检测方法
对石蜡切片进行人工显微切割提取DNA，以一些微卫星点为标记指导合成引物进行PCR，通过凝胶电泳分析得出MSI谱，进行比较分析。最常用的2个Promega分析系统由5个单核苷酸标记点(BAT-25、-26，MONO-27，NR-21、-24)构成;而美国国家癌症研究所(NCI)参考系统由3个双核苷酸(D2S123、D5S346和D17S250)和2个单核苷酸(BAT-25和-26)构成。当胚系谱中微卫星的长度改变，MSI的诊断即可成立。
根据微卫星的数据分析可有3种结果：高微卫星不稳定性(MSI-H)、低微卫星不稳定性(MSI-L)和微卫星稳定(MSS)。
2、免疫组化(ICH)检测方法
主要的DNA MMR基因包括MLH1、MSH2、MSH6、PMS2和PMS1。ICH方法通常检测MLH1、MSH2、MSH6和PMS2这四个基因。相比PCR的方法，ICH分析更为方便和廉价。此外，ICH分析能够直接检测到可能发生突变的基因。在MMR蛋白异源二聚体配对中，MLH1和MSH2是必需的二聚体。
备注：*MSH2和MSH6表达缺失通常由于MSH2胚系突变，尽管还可以通过能够灭活MSH2基因的临近的基因EPCAM转录翻译引起。#MLH1可通过胚系突变或MLH1启动子高度甲基化而灭活。MLH1启动子甲基化通常伴有体细胞BRAF V600E突变。缩写：+，表达;-，缺失;
目前，对具有临床病理学特征的结直肠癌进行MSI检测可降低Lynch综合征的临床漏诊率，同时MSI检测对于明确诊断、指导临床预后评估、用药及随诊均具有重要的意义，所以我们应该利用好MSI检测这一手段。
