咽喉镜检查一般不会引起剧烈疼痛反应，常人可耐受，所以不要有太大的心理负担，但由于使用器材、个人耐痛能力不同，部分人可能会出现不适。
如果是一般的喉镜检查，如间接喉镜、硬性喉镜或纤维喉镜，通常做咽喉镜前会有检查医生进行咽喉、口腔黏膜表面麻醉，会使用喷雾的形式，一般不会有疼痛的感觉，但不排除有些患者天生痛觉反应敏感，会有轻微疼痛感。在喉镜检查时也会有恶心、呕吐的反应发生。
如果使用直达喉镜检查，一般会在全身麻醉下进行，在检查中患者感觉不到任何痛苦，术后可能会出现咽喉部疼痛，是由于在检查过程中造成咽喉部黏膜擦伤导致，可适当用漱口液漱口，保持口腔卫生。如果黏膜擦伤较为严重，可以短期应用抗生素缓解。
检查前最好少吃或不吃东西，避免发生呛咳，需提前完善乙肝、丙肝、梅毒、艾滋病等常规检查；做喉镜检查时可能咽部有恶心感，需要向咽部喷表面麻醉剂，对于麻药过敏者慎用；做完喉镜2小时内尽量不要饮水和进食，以免因麻醉作用发生呛咳。
