激躁性大肠症候群和植物神经功能紊乱、饮食习惯、脾胃虚弱等因素有关，而疾病发作与肠道器质性因素无关。当人体长期处于不良的情绪当中，如紧张、抑郁，就会造成植物神经功能紊乱，而人体的消化系统同时也受到植物神经的控制，所以会诱发激躁性大肠症候群的发作。
部分人在平素不注意饮食问题，甚至会吃一些刺激性、导致过敏的食物，比如辣椒、大蒜等，这一类食物会导致肠道出现应激反应，从而出现激躁性大肠症候群。不少人的身体上会存在有脾胃虚弱，这些人不仅会表现为胃消化不良，同时还会存在有大肠清浊不分、升降失和的表现，从而引起肠道功能紊乱。
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