晨起咳嗽最常见的疾病有两种，一种是咳嗽变异性哮喘，另一种是慢性支气管炎，具体如下：
第一、咳嗽变异性哮喘，以咳嗽为主要表现的哮喘，主要症状就是咳嗽，而咳嗽通常为刺激性干咳，在夜间或晨凌晨发作，而且会被诱发因素所诱发，例如冷空气、过敏原、闻异味、闻烟味等等。
第二、慢性支气管炎引起的咳嗽通常在早晨比较明显，但是慢性支气管炎还会伴有咳痰，而痰量相对较多，痰的性质典型的是白色泡沫样痰。
虽然早晨起来咳嗽最常见的是以上两种疾病，但是也还有其他的疾病需要鉴别。有症状的时候首先要做胸部影像学的检查，进行初步的鉴别诊断，再做进一步的检查和判断。
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