生殖器疱疹很难彻底治疗，生殖器疱疹是由于单纯疱疹病毒感染所引起的性传播疾病。初次感染病毒后，疱疹病毒会潜伏在局部骶神经节中逃避机体免疫系统的监视，当机体免疫力下降时，比如劳累、酗酒后，就有可能引起疱疹病毒复活，所以生殖器疱疹很难彻底治愈，即使有抗病毒药物，如阿昔洛韦、伐昔洛韦等，可以控制急性期生殖器疱疹症状，但也有复发的可能。
疱疹与自身机体免疫功能关系很大，只能尽量减少复发的周期频率，一方面可以用提高机体免疫力的药物，如转移因子、胸腺肽、香菇多糖等，另一方面也可以采取大剂量抗病毒药物，用长期内服的方式减少病毒复制，减少复发。但不能保证停药后生殖器疱疹不再复发，所以平时加强身体锻炼，养成良好的生活作息，对于减少疱疹复发起关键作用。
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