绒毛状腺瘤伴低级别上皮内瘤变意味着良性肿瘤，一般通过单纯的手术切除可以获得治愈。临床上直径小于1cm的绒毛状管状腺瘤，通常采用内镜下完整切除，直径超过1cm时，使用内镜下切除有出血或穿孔的可能，主张行局段肠管切除，可以采用开放手术，也可以采用腹腔镜下肠管局段切除，切除以后无需做化疗。在结肠和直肠的良性肿瘤病变中绒毛状管状腺瘤有一定的恶变可能，一般认为恶变的概率在5%左右。低级别上皮内瘤变意味着是良性肿瘤，通过局部切除可以获得治愈，如果是高级别上皮内瘤变通常认为是癌前病变或早期癌症，需要进一步做肠癌根治手术治疗。
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