缺钙会导致骨痛，严重的情况还会出现病理性骨折、骨骼的畸形。对于一些青少年而言，如果说长期的低钙，会导致生长缓慢、骨质软化，还有佝偻病、骨质疏松、纤维性骨炎等。长期的慢性低钙除了会引起骨骼的病变，也会引起一些软组织还有皮肤的病变，皮肤可能会出现干燥、没有弹性，色泽灰暗或者出现皮炎、瘙痒的症状，毛发也可能会出现稀疏，指甲也容易出现变薄易脆，牙齿也会出现牙齿松动。
低钙血症也对白内障有一定的影响，研究发现的低钙血症会引起白内障。除了对骨骼及皮肤系统的影响，对神经系统也是有一定的影响，因为钙离子可以降低神经肌肉的兴奋性，血钙降低会让神经肌肉的兴奋性增高，从而出现肌肉的痉挛，也就是抽搐的表现。除此之外，缺钙也会引起心血管系统的病变，导致心律失常，甚至会出现心力衰竭的表现。
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