宫颈癌与HPV感染有关系，特别是与高危的HBV感染有关联。通常HPV16、18与70%的宫颈癌有关，HPV39也是高危HPV阳性，与宫颈癌也有密切的关系。HPV39阳性不能单纯的判断是否严重，要结合TCT的检查，同时必要的时候还要进行阴道镜的检查。只有阴道镜下取活检，了解病理的情况，才能判断其严重程度。如果宫颈病变为CIN2以上就需要手术治疗，如果是CIN1以下，则可以使用药物来帮助清除HPV。因此单纯的HPV39阳性，不能说明病变的严重程度。
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