不同医院的甲功全套检测项目可能会有所不同，通常甲功全套包括甲状腺功能和甲状腺自身抗体。甲状腺功能又包括T3、T4、游离T3和游离T4，以及促甲状腺激素也就是TSH。甲状腺自身抗体又包括甲状腺抗过氧化物酶抗体、甲状腺球蛋白抗体以及促甲状腺素受体抗体。有些医院还会检测反T3和甲状腺球蛋白，其中甲状腺功能检查可以判定甲状腺功能是正常、亢进或者减退。甲状腺自身抗体有助于判断是自身免疫性甲状腺疾病，还是非自身免疫性甲状腺疾病。
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