久坐后肛门疼痛原因如下：
1、有可能是得了比较严重的外部痔疮，由于外部痔疮产生直接产生在齿状线的正下方，这个位置是属于人体神经系统的重要控制区域，这里的感觉神经非常的敏感， 而且人坐的时间久，也会因此影响肛管动脉的血流， 从而引起痔疮的产生,。
2、因为坐的时间太长，血流不通畅，因为肛门处于人体比较低的位置，长时间保持一个姿势，导致肛门处被压迫，阻碍血液的正常流通，如果一旦血液回流不畅就会导致肛门组织水肿，引起比较强烈的坠痛感，造成肛门的疼痛，所以不能久坐。
3、患者可能伴有肛裂或肛肠炎的情况，还有可能是长了肛门瘤。
综上所述，久坐肛门疼痛是因为得了痔疮，或者肛门处血液不循环。
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