肛门长小肉疙瘩，首先挂结直肠肛门外科或者是肛肠外科。但有时就诊医院可能比较小，没有结直肠肛门外科，也没有肛肠外科，甚至没有结直肠外科，此时应该挂胃肠外科。如果没有胃肠外科，应该挂普通外科。诊所、乡镇医院、社区医院普通外科可能不细分，此时可以挂外科。
就诊后会做相应检查，如果就诊医院无法检查，会推荐患者到有专科门诊的医院进行检查。比如社区医院可能没有外科或者结直肠肛门外科医生，会推荐患者到更大的医院就诊。上述科室通常可以做肛门视诊、触诊，甚至还可做肛门指检、肛门镜检查，然后明确小肉疙瘩的性质。最常见的情况是痔疮，还有可能是肥大的肛乳头等。
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