由于骨结核形成了局部的脓肿，首先最重要的是要做全身性的抗结核治疗。当结合脓肿形成说明炎性反应已经很长时间了，一定会伴有一定程度的结核中毒表现，所以要早期的联合用药，使用抗结核药物，足疗程，足药量，系统用药，将结核杆菌控制住。当急性感染期的时候，是没有办法做手术清除脓肿的。当全身治疗比较系统，而且局部相对稳定，并且形成死骨之后，可以做局部的脓肿清除术。脓肿感染病灶彻底清除，将坏死骨摘除，根据情况决定是否留置抗结核药物和抗菌药物。
