超声波碎石对肾脏基本上没有太多影响，超声波碎石是一类碎石方式，在肾结石治疗中，通过经皮肾镜抵达结石部位后，将超声探杆深入进行超声碎石。此类碎石方式既能有效粉碎结石，又因为有吸取作用，可以将结石残渣吸取出来，因此此方式是结石治疗中较为重要的方式。
超声碎石对肾脏而言是一类比较安全的方式，因为在治疗中的主要风险即感染和出血，此两类风险都来源于经皮肾镜技术，而并不是碎石方式。在肾脏的经皮肾镜治疗中，出血主要是由于穿刺引起的血管损伤，而感染的主要原因在于液体灌注时压力较高，导致细菌进入血液，从而导致脓毒血症发生，严重时出现尿源性脓毒血症，引起感染性休克。超声碎石除了粉碎结石，也有一定的吸取结石的作用，可以有效减轻压力，从而减少感染的发生，因此是一种比较安全、有效的碎石方式。
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