如果发现上厕所肛门裂开的疼，可能有以下几种原因：
1、可能是由于肛裂导致的，这种情况一般伴随有明显的便秘，而且是排便后疼痛，疼痛比较剧烈，难以耐受。
2、可能是由于痔疮引起的，而且是痔疮合并感染或者是血栓性外痔等情况，这种情况伴随有明显的便后疼痛、出血，同时可能伴有肿块的突出。
3、上厕所肛门疼可能是由于直肠炎症导致的，由于肠液刺激肛周黏膜的皮肤导致的疼痛。
如果发现上厕所肛门裂开的疼，建议还是到正规的专科医院系统的检查，明确诊断后采取及时有效的对症治疗。
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