细菌性急性肠胃炎的患者可以应用的药物，主要是需要结合血常规、大便常规等情况，有无白细胞、红细胞，可以应用杀菌药进行治疗，常见的抗菌药物有诺氟沙星、左氧氟沙星以及三代头孢菌素类，诸如头孢噻肟、头孢哌酮等。也可以用止泻的药物，比如蒙脱石散、地芬诺脂等相关的药物，细菌性急性肠胃炎患者也可以出现肠道菌群紊乱，或者益生菌方面的失调，可以应用益生菌的补充剂，比如双歧杆菌三联活菌胶囊、枯草杆菌二联活菌胶囊以及地衣芽孢杆菌胶囊等。
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