肾结晶被认为是肾结石的启动因素，结石可分为晶体和基质，主要是晶体，根据晶体的不同，可分为很多种类，对于碳酸氢钠而言，主要作用在于碱化尿液，预防其中一部分结石的形成。
对于其他类型的结石，并没有明显的作用，甚至还可能会加重结石的形成，所以在碳酸氢钠治疗肾结晶的时候，需要根据具体的结晶成分，来进行分析，在所有的结晶当中尿酸结晶和胱氨酸结晶的处理，一般建议碱化尿液，而碱化尿液可以使用枸橼酸氢钾钠，也可以使用碳酸氢钠来减少尿结晶的形成，但是其他的结石，尤其是感染性结石，并不需要碱化尿液，甚至需要酸化尿液，所以用碳酸氢钠治疗感染性结晶，往往效果并不佳，所以要根据具体的结晶成分来进行相应的处理。
