运动的时候肾疼可能的原因如下：
1、肾结石、肾结晶，由于肾结石、肾结晶在运动的时候会引起周围肾组织的摩擦、撕裂等损伤。
2、肾囊肿，由于较大的肾囊肿会因剧烈的运动，而引起囊肿的溃破，或对周围肾组织挤压。
3、肾积水，由于泌尿系炎症或梗阻性因素等导致肾积水，会由于运动而引起肾的损伤。
4、肾肿瘤，由于肾肿瘤后期剧烈运动，会引起肿瘤血管的破裂、出血。
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