甲硝唑主要是用来治疗厌氧菌的感染。厌氧菌是指生活环境不需要氧气，在无氧或者是缺氧的环境下，更利于生长、繁殖。一般的病症有：一、口腔、牙及牙周的感染。二、胃部的感染。比如幽门螺杆菌的感染，常常会用到甲硝唑。三、肠道感染。通常阑尾炎、胆囊炎都会用到甲硝唑，以控制和治疗胆囊炎的症状。四、滴虫性阴道炎。也是甲硝唑常用的病症。
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