细胞凋亡通常是指细胞的程序死亡，生物体发育过程中普遍存在，就像树叶和花的自然凋落一样。而细胞坏死被认为是因为病理而产生的被动死亡，是病理性的细胞死亡。
两者的范围不同，细胞凋亡多见于单个散在细胞，而细胞坏死所见的范围是大片组织或者是成群的细胞，细胞凋亡时细胞膜保持完整，一直到形成凋亡小体，而细胞坏死细胞膜会破损，细胞凋亡，细胞器没有明显的变化，而细胞坏死细胞既可以发生肿胀，内质网崩解。细胞凋亡时可以有蛋白质合成，而细胞坏死则无蛋白质合成。细胞凋亡时通常受基因调控，而细胞坏死常常是被动进行。
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