部分治疗霉菌药物可以在月经期间使用，比如口服、外洗、外涂药物等，而阴道内塞药则禁止使用。月经期由于经血流出，不适合进行阴道塞药，但是外洗、外涂、口服等药物影响较小，患者可适当使用。部分患者可能霉菌性阴道炎较严重，或复发频率较高，一般需要口服治疗，月经期也可使用。
霉菌性阴道炎不仅需要治疗单次炎症，还需注意预防复发，临床约10%的患者会出现炎症反复发作。霉菌性阴道炎的反复发作令患者非常烦恼，如果一年发作4次以上，不仅需要在发作时用药，还需在平常不发作时维持用药，包括口服、内塞等药物。但月经期能否使用治疗霉菌药物，需根据药物种类决定。
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