憋尿后腰部疼痛的原因是因为尿液返流到肾脏，导致肾脏的压力，肾盂内的压力增高。一般情况下，正常的尿液从肾脏产生过以后，通过输尿管流到膀胱，再通过膀胱从尿道排出体外。尿液是从上到下，不会返流的。因为在输尿管和膀胱连接的部位，有一圈肌肉，叫括约肌，起到了阀门的作用。只能让尿从上往下流，不会让尿反过来流。但是如果膀胱内的压力过高，比如憋尿，导致膀胱内压力过高，会有一部分尿液返流回肾脏，造成肾盂里的压力增高，引起肾脏的酸胀疼痛不适。同时长时间的憋尿或者经常的憋尿，导致尿液返流会引起泌尿系的感染，甚至会造成肾炎的可能。
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