腹泻和便秘交替常见的原因有两个，一个原因是糖尿病人由于累及肠道的神经可以表现便秘和腹泻交替。另一个常见的原因是功能性胃肠道紊乱，特别是肠易激综合征。
肠易激综合征分为好多种，有腹泻型的，也有便秘型的，肠易激综合征的特点腹痛或者腹部的不适，排便后可以缓解，同时伴有排便的性状和习惯的改变。结肠癌又有肿瘤环周生长，引起肠腔的梗阻，有一些可以出现排便次数减少和腹泻交替的现象，有时候误以为是便秘，应该警惕，不管什么原因出现腹泻和便秘交替都需要检查。
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