对于部分心脏病人是可以做肠镜的，但严重的心脏病人禁忌进行肠镜检查。心脏病人按照其心脏病的种类可以分为不同的类型。心律失常、轻中度心功能不全的心脏病患者在病情得到控制后，出于诊断和治疗的目的，完全可以进行肠镜检查。对于冠心病患者，如果存在心肌缺血的证据，则肠镜检查容易刺激交感神经兴奋，引起冠状动脉痉挛，加重心肌供血不足，甚至导致心肌梗死的发生，因此做肠镜具有极高的危险性。如果必须进行肠镜检查，也需要在冠心病的病情得到很好的控制，以及医护人员严密监测心脏生命体征的情况下，进行肠镜检查。
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