苍蝇可以通过体内外携带的病毒体，以及苍蝇特有的进食类特点，将多种病原体传播扩散出去，主要包括细菌性痢疾、伤寒、副伤寒、霍乱、细菌性食物中毒，以及炭疽、破伤风、气性坏疽、化脓性球菌感染等疾病，病毒性疾病，如脊髓灰质炎、病毒性肝炎、沙眼和天花等。
还有寄生虫病如蛔虫病、蛲虫病、囊虫病、阿米巴痢疾等原虫和蠕虫病。此外，还可以传播沙眼和雅司病等。由此可见，搞好环境卫生，消灭苍蝇，对预防传染病尤为重要。
