采用鼻拭子进行核酸检测时，可能导致疼痛的感觉。鼻拭子进行核酸检测时，医务人员用鼻拭子插到鼻腔深处，采集鼻黏膜的细胞，所以可能引起局部的疼痛、不适的反应。尤其是慢性鼻炎或者鼻窦炎的病人，不适感可能更加明显。
因此在鼻拭子检测核酸时，应向检测的医务人员提供相关的键康信息，如是否有鼻部的局部病变、有无慢性的鼻窦炎或者鼻中隔偏曲等。如有上述情况存在，可能影响标本采集的成功率。如果鼻拭子采集标本不理想，或无法完成的情况下，可以换用咽拭子的方法采集标本进行核酸检测。
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