肺结核痰检阳性患者若经过抗结核治疗，效果明显者两周痰检阴性率可以达到90%以上，四周痰检阴性率可以达到95%以上，使结核杆菌传染性明显下降。但也有的耐药结核菌感染，使抗结核治疗效果下降，痰检阴性率也会明显下降，甚至很长时间不能够转阴，给治疗带来一定困难。
此时需要根据药物敏感试验调整治疗方案，应用敏感药物联合治疗，并且延长治疗疗程，防止复发。对于肺结核患者，需要注意隔离，尤其是痰检阳性患者，避免传染给家人，特别是家中有儿童的家庭，需要单独隔离。
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