幽门螺杆菌弱阳性是否需要治疗要综合判断，弱阳性有可能是抗体，即抽血化验发现曾经感染或者现症感染，不能作为治疗的指导方案。快速尿素酶试验，在胃镜下夹取标本放到小杯中，观察是否变色。弱阳性可能是轻微变色，变成淡粉、玫瑰红。这种情况建议病人再做尿素呼气试验，碳13、碳14均可，根据呼气的结果考虑是否治疗。
综合胃部的情况，如果有溃疡、癌变、非淋巴组织相关性淋巴瘤，严重的胃食管反流等。如果确定有明显感染，均应该根除。如果病人没有任何症状，是备孕期、妊娠期，还有小儿、年老体弱的病人，可以暂缓治疗。部分病人有不明原因的缺铁性贫血、再生障碍性贫血、特发性血小板减少性紫癜等血液系统疾病，也要酌情根除治疗。
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