弓形虫的治疗最主要的方法是药物治疗，通过有效的药物治疗可以杀灭弓形虫，还可以杀灭包囊。临床上可用的药种类比较多，比如乙胺嘧啶、磺胺嘧啶、复方新诺明、螺旋霉素、克林霉素、阿奇霉素等，均可能成为有效的抗弓形虫病药物选择。
在临床上选药的时候还要格外关注病人本身的具体的情况，根据患者的具体情况确定最合适的方案，具体如下：
1、要考虑患者是不是妊娠状态，因为孕妇与非孕妇用药选择不同；
2、患者感染的是不是先天性的弓形虫病，用药选择也会有所不同；
3、病人免疫功能是正常还是免疫功能受损，免疫功能受损的人最具有代表性的是艾滋病人群，这类患者在选药的时候用药的疗程以及各方面也会有所不同。
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