女性泌尿系统感染伴腰疼的，可能是泌尿系统感染加重，上行感染至肾盂引起肾盂肾炎。因此伴有腰痛症状还要测量体温，如果体温高于38℃伴有寒颤高热，应及时行血常规检查，最好进行血培养。如果进行药敏实验发现血中有具体细菌，应给予敏感的抗生素治疗。同时要大量饮水而且不要熬夜，避免着凉久坐以及重体力活动。但如果只有泌尿系统感染伴腰疼没有发热，需要明确是否腰疼来源于泌尿系统感染，有时泌尿系统感染合并腰肌劳损以及腰间盘的症状。所以应进行针对性检查，明确腰疼与感染的相关性再治疗。
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