先天巨细胞病病死率高，受感染的胎儿除流产、死产外，常引起先天性畸形，严重者在生后数天或数周内死亡。活着的孩约有5%表现为典型的多系统、多脏器受累，新生儿多系统、多脏器受累特征是单核巨细胞系统和中枢神经系统受侵犯，比如小头畸形、黄疸、肝脾肿大、脑积水等，约有5%表现为非典型临床症状，90%留有后遗症，如生长迟缓、智力障碍、癫痫、视力减退、听力障碍等。
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