甲硝唑是用于治疗和预防厌氧菌感染的疾病，或者是局部感染的疾病。比如最常见的就是厌氧菌感染的腹腔感染、消化道感染，还有女性生殖道的感染。特别是女性的宫颈炎、阴道炎，经常用到甲硝唑，给予治疗厌氧菌感染。还有皮肤以及软组织的感染，或者是骨头跟关节等部分的厌氧菌感染，经常用到。所以甲硝唑是消炎药，是治疗厌氧菌感染的疾病的药物。还可以治疗脑膜感染或者心内膜炎的感染，可以配合其它的抗生素一起联合治疗。还可以治疗口腔的厌氧菌感染。
