乙肝五项不能查出来是否有丙肝，乙肝与丙肝是两个不同的疾病，虽然损伤器官主要都是肝脏，但这是两个不同的病原体。乙肝病毒属于DNA病毒，丙肝病毒属于RNA病毒，这两个病毒感染人体之后，让人体产生的抗原、抗体系统是不一样的。乙肝病毒能够让人产生乙肝的表面抗原、E抗原，产生的抗体有可能是表面抗体、E抗体与核心抗体。丙肝病毒感染之后，只能产生一套抗原、抗体，也就是通过抽血，会检查丙肝的抗体以及丙肝的抗原。在检查化验方面，这两者是没有交叉的，乙肝五项并不能检查出是否有丙肝，只能检查出是否有乙肝。
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