支原体感染可以通过血液或其他体液检测，如尿液、痰液等，还可以通过前列腺液检查，而检查具体指标不同，可以选择RNA或者进行培养检查，还可以检查血液中抗体情况。
临床较为简单为抽血查支原体抗体，若担心有泌尿生殖系感染时，可以通过检查尿液或使用尿道试纸进行支原体培养，也可以检查体液中的支原体、RNA进行判断。由于各种检查方式所需标本不同，因此检查所需时间也各有不同。
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