临床上的五联疫苗和五价轮状疫苗，是两种完全不同的疫苗，具体的区别体现在预防疾病种类、接种时间等方面。五联疫苗和五价轮状疫苗，都属于国家二类疫苗，因此对于有接种计划的婴幼儿，家长可根据个人情况选择合适的疫苗接种。
1、预防疾病种类：五联疫苗是一种混合疫苗，是脊髓灰质炎灭活疫苗、无细胞百白破疫苗，以及B型流感嗜血杆菌疫苗的联合疫苗，可以同时预防百日咳、白喉、破伤风、脊髓灰质炎，以及B型流感嗜血杆菌这五种疾病，称为五联疫苗。而五价轮状疫苗，是包含五种牛轮状病毒重配株(G1、G2、G3、G4、G9)的疫苗，只是针对预防轮状病毒的感染；
2、接种时间：五联疫苗一般是在出生后的3个月、4个月、5个月完成基础免疫的三针。在婴幼儿1岁半时，再进行加强针的接种，所以五联疫苗一共是四针。五价轮状疫苗一般第1剂是在6周龄，第二剂是10周龄，第三剂是14周龄，一共需要注射3次；
3、接种方式：五联疫苗是通过肌肉注射进行接种，而五价轮状疫苗是口服制剂；
4、其他：五联疫苗保护率接近100%，五价轮状疫苗对五种病毒的保护率约为95%。五联疫苗适用于2个月以上的婴幼儿，而五价轮状疫苗适用于6-32周龄婴幼儿。
