癌症做穿刺常常是为了明确诊断，比如如果肺部发现了占位，为了明确肺占位的性质，可以在CT引导下做肺占位的经皮穿刺肺活检，穿刺下来的组织常规送病理学的检查，从而明确占位病变的良性或者恶性，并给予后续的治疗指导。同样当肝脏发生了占位之后，可以在B超或者CT的引导下，做经皮肝穿刺活组织检查，取下来的组织同样送病理学的检查，来明确肝脏占位的良性或者恶性。
除了通过穿刺做组织活检之外，对于合并胸腔积液或者腹腔积液的病人，也可以通过穿刺的方法引流胸腔积液或者腹腔积液。引流出来的液体也常规送病理学的检查，从而判断胸腔积液或者腹腔积液的良性、恶性，并根据病理学回报的结果，给予后续的相应治疗。除此之外，还能根据是否发生胸膜或腹膜的转移情况，来判断病人的预后。
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