扁桃体发炎最常见的致病菌还是革兰氏阳性球菌，所以可以首选青霉素类的消炎药物，也可以选择头孢类的抗生素。如果头孢类或者青霉素类药物都过敏，可以选择大环内酯类的抗生素，也可以选择喹诺酮类的消炎药物，临床上比较常用的抗生素有青霉或者头孢类的消炎药，如头孢甲肟钠或者头孢唑林钠、头孢替唑钠等。大环内酯类的抗生素比如红霉素、阿奇霉素等，也可以选择左氧氟沙星或者莫西沙星等抗生素来治疗，在用药治疗期间一定要注意多喝水，适当补充维生素C。
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