霉菌感染容易反复发作，对于反复发作的霉菌感染，如果要根治，一定要增加口服抗真菌药物。可以进行阴道分泌物的真菌培养和药敏，治疗上可以选择敏感的抗真菌药物，主要包括氟康唑、伊曲康唑、两性霉素B等等，同时根据药敏的结果，选用合理的抗真菌药物。如果口服药物不能够完全缓解症状，也建议同时局部用药，包括咪康唑、氟康唑、硝基咪唑和克霉唑等等局部的药膏，或者是阴道的栓剂，只有局部的阴道栓剂和口服药物同时治疗，才能更有助于霉菌的去除。
霉菌的反复发作也与机体的自身免疫力有关，所以一定要提高自身的免疫力，避免经常性的熬夜，或者进食过多辛辣、刺激、过甜的食物。如果霉菌的反复发作与同房有关，也需要性伴侣同时治疗。如果用药之后症状不缓解，也要寻找是否有糖尿病的病因，因为糖尿病的病人容易出现霉菌反复发作，不容易治疗。总之，霉菌性阴道炎如果想根治，需要口服用药加阴道用药，加全身免疫力的提高以及去除一些诱因和并发的疾病。
