月经期检查激素六项属于卵泡早期，一般是在来月经的第2-5天抽血进行检查。这个时候是最基础的内分泌状态，可以反映卵巢的功能。对于长期不来月经的患者，而又急于了解检查的结果，则随时可以检查。
查女性激素六项之前，至少一个月不能用性激素类的药物，包括黄体酮、雌激素类以及避孕药等。一般检查女性激素六项是在来月经的第2-5天抽血检查，可以不查孕酮。一般孕酮选择在黄体期进行检查，根据孕酮值的高低，可以判断月经周期的时段。月经稀发以及闭经者，若排除怀孕，双侧卵巢无大于等于10mm的卵泡，子宫内膜的厚度小于5mm，也可作为基础状态。
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