扁桃体主要作用就是免疫功能，临床上正常情况下，扁桃体能产生大量的淋巴细胞和抗体，一旦患者口咽部有病毒或者细菌入侵，淋巴细胞和抗体能够发挥免疫作用，将病毒和细菌杀灭，使患者不容易出现咽喉部的感染，甚至气管、肺等感染。
如果患者扁桃体经常发炎，或者扁桃体丧失正常的功能，就没有免疫功能，导致患者呼吸道的第一道关口丧失了作用，患者容易出现咽喉炎，容易反复发作扁桃体炎，甚至出现支气管炎、肺炎等相关的呼吸道系统的疾病。临床上对于扁桃体炎的患者要加强抗炎治疗，避免病情反复迁延不愈，对于慢性扁桃体炎的患者，可以做扁桃体切除手术，避免感染灶出现。
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