大部分甲状腺炎和自身免疫损伤有关，因此甲状腺炎多是女性出现，甲状腺炎分类上并没有女性甲状腺炎。女性常发生的甲状腺炎，如亚急性甲状腺炎，是病毒感染相关性的自限疾病。如果女性过度的劳累、紧张，使抵抗力下降，病毒乘虚而入可能造成发热、颈部疼痛、乏力，造成甲状腺功能一过性受损，但是经过休息绝大部分亚急性甲状腺炎都能缓解。
女性甲状腺炎还可以出现产后甲状腺炎，往往发生在产后一年之内，怀孕前甲状腺功能化验可能存在甲状腺自身的抗体，此人群产后发生甲状腺炎的机会比较多。产后甲状腺炎会出现一过性甲状腺激素水平增高，一过性甲状腺功能减退。随着病情的好转都能够症状减轻，恢复正常，很少遗留终身性的甲减。
女性甲状腺炎常见的是自身免疫性疾甲状腺炎里的桥本甲状腺炎，是免疫系统在保护甲状腺时误伤甲状腺，同样可以出现甲状腺功能的损害，最后会发生甲状腺功能减退的机会明显增多。甲状腺炎的治疗主要是针对功能进行治疗，如果造成甲状腺损害引起的甲状腺功能明显的异常，如甲减，需要使用左甲状腺激素替代治疗。
