手足口病患者的化验单与普通发热疾病的化验单相比，没有明显的特异性。一般常规检查的化验就是血常规、C反应蛋白、肝功、心肌酶、肾功等。从血常规上看，手足口病孩子的血常规当中白细胞计数一般会升高，一般C反应蛋白也会升高，严重的可以超过30-50mg/L，就说明口病相对比较严重。
同时可以查手足口病的病原学检查，可以查柯萨奇病毒和肠道病毒EV71。如果是肠道病毒EV71显示阳性就要注意，因为EV71病毒感染所致的手一般重症为主，容易合并有神经系统的并发症，出现手足口病引起的中毒性脑病、中毒性心肌炎，甚至心力衰竭。
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