HPV51型阳性，目前对于HPV病毒的治疗还没有一种特别有效的或者叫做特效的治疗方法和手段，没有一种方法能够完整的、完全的将HPV病毒清除。对于HPV病毒感染往往采取比较保守的治疗手段，包括干扰素的凝胶阴道局部上药，可以起到干扰病毒复制的作用。另外还有一些可以采取光动力疗法来进行HPV病毒的治疗，但是治疗效果目前都不是非常确切。
对于HPV51病毒阳性的病人，首先一定要排除相应疾病，包括宫颈癌、癌前病变以及生殖道的尖锐湿疣，可以通过妇科检查以及宫颈癌的细胞学检测来排除相应的疾病。如果TCT阳性，一定要进行进一步的检查和治疗，包括阴道镜的检查、宫颈的活检，并且要根据活检的病理切片结果来进行分层的治疗方法。如果没有导致任何的疾病发生，也就是没有宫颈癌，没有宫颈癌前病变和细胞学的异常，也没有生殖道的尖锐湿疣，单纯的HPV病毒感染可以给予一段时间的观察，6-12个月再进行复查即可。
