肛门疣病经过治疗是可以消退的，但是容易复发。它是病毒感染引起，由于该种病毒喜欢在温暖、潮湿的环境中繁殖，所以肛门直肠区和生殖器区最容易发生本病，它常见的复发的原因有以下几个方面：
一、再次的感染；
二、自身的接种；
三、常有亚临床的感染，不易发现；
四、还有一些潜在性的隐性感染。
治疗后要定期随访，即使是很微小的病灶，一经发现也要立即治疗，同时要检查性伴侣是否有该种疾病，要一起来治疗，同时可以用一些全身性的免疫治疗，比如用胸腺肽、干扰素来进行免疫性的治疗，还可以用中药内服和局部用中药熏洗，一起来减少它复发的几率。
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