引起心肌水肿的主要原因是心肌细胞炎症损伤，炎症反应均会有渗出，因为细胞在炎症刺激后可能会发生肿胀。细胞外基质可能会有较多炎性因子趋附或者中性粒细胞聚集，导致心肌细胞可能出现渗出、水肿、损伤，甚至后期有纤维结缔组织增生、心肌重构，常见于急性心肌炎。
无论是感染性心肌炎或理化因素导致的急性心肌炎，心肌细胞膜可能会出现损伤，导致心肌细胞膜通透性发生改变，所以会有心肌细胞酶类或者小分子渗到心肌细胞组织间隙，出现不同程度心肌水肿。尤其是在进行心脏影像学检查，如心脏彩超或心脏核磁，甚至心脏核素检查时，会明显观察到心内膜下存在炎症相匹配的心肌水肿部位。
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