根尖囊肿一般情况下不会出现癌变，但是它还是有一定癌变的可能，只是这种可能性非常小。根尖之所以会出现囊肿，多数是因为牙髓腔内有感染的物质，没有及时接受治疗，而且有反复发作黏膜流脓的情况，最后变为囊壁，形成囊肿。根尖囊肿在进行常规的根管治疗以后，一定要行使根尖手术，将囊肿切除干净，不然囊肿会逐渐生长，甚至会压迫到神经和血管，影响面部的血运和感觉。根尖囊肿有的时候并不具备自限性，有的囊肿可以长到3cm直径或者5cm直径大，严重影响到牙槽骨出现吸收的情况。
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