嘴巴疱疹需要鉴别引起疱疹的原因进行用药，具体如下：
1、病毒感染：主要是有红斑伴珍珠状小水泡，颜色透亮，米粒或绿豆大小，属于疱疹病毒感染，用抗病毒药物如阿昔洛韦软膏、喷昔洛韦软膏或干扰素凝胶等对疱疹病毒感染有效；
2、细菌感染：脓疱疮是细菌感染引起的疱疹，表现为水泡上面有黄白色的脓液且呈半球形，上面液体是淡黄色，黄豆大小，泡壁较薄，属于细菌感染，应该涂抗生素药膏，如红霉素、青霉素软膏，还有百多邦、夫西地酸、复方多粘菌素B软膏等，此类抗生素软膏对细菌感染引起的疱疹、脓疱有治疗效果，对病毒感染治疗效果不明显。
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