脑部手术的并发症主要包括颅内再次出血、脑水肿、颅内感染等，其它的一些并发症主要取决于手术的方式、手术的部位等，不同的手术方式产生的并发症不同，比如大脑深部的开颅手术并发症，要比表浅部位的肿瘤并发症相对较多。
除了上述常见的并发症外，一些特殊部位的手术也会有相应的并发症，比如鞍区部位的肿瘤，术后患者可能会出现视力障碍、垂体功能下降、尿崩症等。左侧颞叶手术术后，患者可能会出现癫痫、失语等。枕叶的手术可能会影响患者的视力，桥小脑角区的肿瘤术后，患者可能会出现面瘫、听力障碍、面部麻木等，这主要是因为特殊部位的神经受损后产生了相应的临床症状。有些术后并发症经过药物治疗后，患者能够逐渐恢复，而有些术后并发症可能需要再次进行手术治疗。
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