霉菌性阴道炎患者通常建议使用抗真菌的药物进行治疗，不建议冲洗阴道，但是建议患者冲洗外阴以保持外阴的清洁。因为冲洗阴道可能进一步破坏阴道本身的环境，导致阴道的菌群进一步紊乱，不利于霉菌性阴道炎的恢复。
健康的女性阴道内的细菌以乳酸杆菌为主，且处于生态平衡的状态。而女性的阴道上皮细胞可以分泌糖原，乳酸杆菌将糖原分解为乳酸，从而维持阴道呈现弱酸性的环境，抑制病菌的生长，以维持女性生态系统的平衡以及女性的阴道健康。如有外来的因素破坏阴道的平衡状态，可能导致致病菌过度繁殖生长引发阴道炎。
