对于初次发作的生殖器疱疹患者，临床上治疗首选的是阿昔洛韦、伐昔洛韦以及泛昔洛韦，一般治疗7-10天就可以有效缓解。但是生殖器疱疹容易反复发作，如果是复发的患者，可以选择和第一次治疗相同的药物进行治疗，一般5天左右就可以有效缓解，但最好在出现前驱症状或者皮肤损害24小时之内开始治疗。对于频繁发作的生殖器疱疹患者，可以采用连续口服抗病毒药物6-12个月治疗。一般生殖器疱疹反复发作的患者，都会伴有免疫功能低下，还可以配合中药以及调节免疫力的药物进行口服，还需要配合有效的体育锻炼。
