正常情况下，奥硝唑可以治疗由厌氧菌感染引起的牙疼，对于非厌氧菌感染引起的牙疼无效。
临床上由厌氧菌感染引起的牙疼有：急性根尖周围炎、急性牙龈炎、急性牙周炎、急性智齿冠周炎。上述炎症都是由厌氧菌感染引起，所以采用对厌氧菌非常敏感的药物奥硝唑治疗，会有一定的作用。使用奥硝唑以后，可以控制厌氧菌，防止其大量繁殖，使炎症加重。控制以后，再配合局部治疗，炎症可以很快被控制住。对于急性牙髓炎、龋病引起的牙痛，采用奥硝唑治疗无效，因为不是以厌氧菌为主的感染。
患者还可以局部进行冲洗、开髓引流，可以明显控制炎症。平时进食后就要进行漱口，最好能刷牙3分钟以上。
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